个税附加扣除的操作是：纳税人的子女接受全日制学历教育的相关支出，按照每个子女每月1000元的标准定额扣除。纳税人在主要工作城市没有自有住房而发生的住房租金支出，直辖市、省会（首府）城市、计划单列市以及国务院确定的其他城市，扣除标准为每月1500元。
【法律依据】
《个人所得税专项附加扣除暂行办法》第五条
纳税人的子女接受全日制学历教育的相关支出，按照每个子女每月1000元的标准定额扣除。
第十七条
纳税人在主要工作城市没有自有住房而发生的住房租金支出，可以按照以下标准定额扣除：
（一）直辖市、省会（首府）城市、计划单列市以及国务院确定的其他城市，扣除标准为每月1500元。
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